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多样性组成谱测序和功能基因测序的区别

更新时间:2021-09-23 15:02:16点击次数:404次

多样性组成谱测序功能基因测序区别

功能基因测序是扩增某一功能的标志性基因序列,解析具有这一功能的微生物组成谱,需要用相应的特定基因引物进行该基因的PCR扩增,然后进行测序,反映的是该特定功能类群微生物的组成结构,一般采用NCBI数据库进行物种注释;

而多样性组成谱多是细菌/古菌16S rRNA基因/真菌ITS进行测序,反映的是细菌/古菌或真菌的光谱种群的组成结构,可以通过PICRUSt等方法预测菌群整体具有的潜在功能特征,关注的对象并不局限于执行某一类特定功能的微生物。

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