二代测序
（高通量测序(High-Throughput Sequencing, HTS）；
新一代测序 (Next Generation Sequencing, NGS) ）
介绍
20世纪90年代，在基因组学发展的需求下，科研人员开发了通量更高、成本更低的测序技术。为了与以Sanger法为代表的一代测序技术进行区分，他们将后来发展的测序技术称为二代测序技术。二代测序技术通常先将样晶DNA打断成几百个碱基对长的片段，然后在片段两端加接头，进行PCR扩增和序列分析。与一代测序Sanger法相比，二代测序技术在处理大规模样品时具有显著的优势，在测序速度及测序通量上具有无可取代的地位，是目前组学研究中的核心技术。 当前主流的二代测序平台有3种，分别为：Illumina公司的Hiseq平台；Themo fisher公司的Ion Torrent平台和华大基因MGISEQ 平台。
优点1. 一次能够同时得到大量的序列数据，相比于一代测序技术，通量提高了成千上万倍；
2. 单条序列成本非常低廉。
缺点
1. 序列读长较短，Illumina平台最长为250-300bp，454平台也只有500bp左右；
2. 由于建库中利用了PCR富集序列，因此有一些含量较少的序列可能无法被大量扩增，造成一些信息的丢失，且PCR过程中有一定概率会引入错配碱基。
应用
二代测序是现阶段科研市场的主力平台，主要应用包括：基因组测序、转录组测序、群体测序、扩增子测序、宏基因组测序、重测序等。由于成本较低，二代测序在医学领域应用也十分广泛，主要包括：癌症基因组、遗传病基因组、肿瘤与代谢疾病等。
