工作流程智能化、测序应用范围广泛、快速获得结果
Illumina公司推出的MiSeq是一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新款测序仪，每次运行能产生超过1Gb的数据，且占地面积仅为2平方英尺。MiSeq的便捷流程和较高准确性，让它成为快速且经济的遗传分析的理想平台，适合广泛的应用。同时Illumina已被FDA大量采购并即将通过FDA认证，12年10月，MiSeq系统的测序通量已升级至8G左右。升级通过两个方面完成，一个是cluster密度的增大，升级后cluster密度增加至15-17million，而pair-end读取的reads数目将会增加至30-34million；另一方面是通过测序读长而提升通量，测序读长达到2*300bp，同时测序速度也有所提升。目前，Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长，Illumina目前内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些，都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。
MiSeq性能参数
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读长（bp） |
测序时间（h） |
总数据量 |
数据质量（Q30） |
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1×36 |
4 |
540-610 Mb |
>90% |
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2×100 |
17 |
3.0-3.4 Gb |
>85% |
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2×150 |
24 |
4.5-5.1 Gb |
>80% |
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2×250 |
39 |
7.5-8.5 Gb |
>70% |
技术优势
1. 实验周期短：从样品制备开始需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。
2. 样品制备流程便捷：需50ngDNA模板，2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。
3. 测序原理精确：MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理。
4. 整合功能完整：MiSeq可以独立完成簇生成，双向测序及数据分析工作，让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。
应用领域
1. 扩增子（PCR）测序、克隆检查等：可应用illumina的扩增子检测试剂盒，可同时完成样本384个扩增子，共36,864个扩增子的检测。
2. 特定区域检测、外显子组测序等：搭配illumina特定区域捕获试剂盒，对基因组上的任意区域进行捕获和测序；还有特制的外显子捕获试剂盒。
3. 微生物测序：可应用illumina的16S rRNA微生物测序试剂盒，并可通过MiSeq内置软件，直接获得分类结果。还可应用MiSeq进行微生物基因组的从头测序。
4. 小基因组测序、转录组测序：包括de novo测序，价格便宜，便于实现De novo组装，更全面的基因注释。
