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一代测序

更新时间:2016-03-07 16:39:57点击次数:1485次

一代测序(Sanger法测序)

介绍

一代测序技术指的是由1975年Frederick Sanger发明的Sanger双脱氧链终止法(Chain Termination Method)。基于第一代测序技术的测序仪几乎都是采用该方法。其核心原理是采用ddNTP取代dNTP,在合成核酸链的过程中ddNTP无法形成磷酸二酯键,从而导致DNA合成反应中断。对每个ddNTP进行荧光标记,产生以A、T、C、G结束的四组不同长度的一系列核苷酸,然后通过毛细管电泳进行分离,通过检测荧光信号获得DNA序列。

优点

1. 一代测序技术的准确性远高于二、三代测序,因此被称为测序行业“金标准”;

2. 一代测序每个反应可以得到700-1000bp的序列,序列长度高于二代测序;

3. 一代测序价格低廉,设备运行时间短,适用于低通量的快速研究项目。

缺点

1. 一代测序技术一个反应只能得到一条序列,因此测序通量很低(通量:指的是单位时间内所能产生的数据量);

2. 一代测序技术虽然单个反应价格低廉,但是获得大量序列的成本很高。

应用

      1. PCR产物测序

对目的基因的PCR产物进行测序,得到目的基因序列;

2. 重测序

突变、SNPs、插入或缺失克隆产物的验证;

3. 分型分析

微生物和真菌分类学鉴定、HLA分型、病毒分型等;

4. 临床应用

肿瘤突变基因的检测和肿瘤个体化治疗,致病基因位点明确并且数量有限的单基因遗传病检测;

5. 对新一代测序技术的结果进行验证。

(编辑:admin)

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