细胞是动植物结构和生命活动的基本单位,生命的本质就是不同类型细胞之间的相互作用网络。传统的基因测序在组织样本或细胞群的整体上进行,细胞之间的差异可能因平均化被掩盖。单细胞测序技术可在单细胞层面揭示每个细胞独特的基因信息及基因表达特征,使不同的细胞类型得以精细区分,并可对不同类型细胞间的相互关系进行更深入系统的研究,有利于我们理解生命现象、探究发病机制、发现诊断生物标志物及治疗靶点。
单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing, scRNA-seq):是在单个细胞水平上对mRNA进行高通量测序,可研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。
单细胞核转录组测序(Single nucleus RNA sequencing, snRNA-seq):是从组织抽提细胞核,然后在单个细胞核水平上对转录组进行高通量测序分析的一项新技术,通过检测单个细胞核的基因表达状态,进而揭示细胞间的异质性。
单细胞免疫受体测序:免疫受体(TCR/BCR)测序是以T/B淋巴细胞为研究目标,在单个细胞水平全面评估免疫受体的多样性,对疾病发生、发展的分子机制研究具有重要的意义。
单细胞转录动态监测测序:利用微流控系统,将mRNA代谢标记和高通量单细胞转录组测序整合,用cell barcode对数千至数万个细胞进行标记,不仅能够在单细胞层面检测到数千个基因的数量,同时检测到RNA转录本的“新”及“旧”,在丰富多维的单细胞测序信息进一步加上了时间的维度,实现更高通量的RNA转录动态检测。
样品要求
样本类型 |
样本量 |
要求标准 |
保存时间 |
运输条件 |
项目周期 |
组织 |
≥100 mg |
新鲜组织 |
<72 h |
2-8℃ |
标准分析:单样本需45d; 2≤样本数≤20需60 d;
高级分析:6-12个月。
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外周血(EDTA) |
≥5 mL |
无溶血 |
<72 h |
2-8℃ |
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PBMC |
细胞数量≥5*105 |
细胞活性≥90% 体积≥500 μL |
-80℃<一周 |
-80℃ |
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细胞悬液 |
细胞数量≥5*105 |
细胞活性≥90% 体积≥500 μL |
-80℃<一周
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-80℃
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穿刺组织 |
≥3条 |
新鲜穿刺组织 |
<72 h |
2-8℃ |
技术流程
组织样本—组织解离—单细胞分离—细胞裂解—mRNA捕获—反转录—扩增—建库—NGS测序—数据质控—生信分析